החל משעות הבוקר של שמחת תורה ועד לשעות לפנות בוקר היום (א) פעלו כוחות משטרת המחוז הדרומי ולוחמי הימ"מ לניטרול מחבלים שחדרו לתחנת שדרות.
סמוך לשעה 04:30 הודיעו במשטרת ישראל כי "לפני זמן קצר הושגה שליטה מלאה וכוחותינו ניטרלו כ-10 מחבלים חמושים בתחנה".
במהלך הניסיון לכבוש את התחנה בשנית, מפקד מחוז הדרום ניצב אמיר כהן הנחה לבצע "סיר לחץ" – ירי חי בכלל האמצעים – על התחנה שבה התבצרו מחבלים תוך שהם מסכנים את כוחותינו.
בחיתוך מצב שהתקיים לפנות בוקר בראשות מפקד המחוז יחד עם מפקד משמר הגבול ופיקוד המחוז, אמר ניצב אמיר כהן למפקדים: ״השוטרים והלוחמים שלנו פעלו לאורך היממה האחרונה באומץ לב ובנחישות רבה. אנחנו בשעה קשה אך עכשיו אנחנו מרימים את הראש וממשיכים לפעול בנחישות ובשיא העוצמה נגד כל איום בכדי לתת ביטחון לאזרחים.
ההנחיה לציבור היא להשאר בבתים, אין אישור לצאת החוצה ואני מבקש מכל מי שצריך סיוע להתקשר למוקד 100 ולמוקדי ההצלה. יש כוחות גדולים של משטרה, מג"ב וצה"ל ונמשיך לתת ביטחון שוטף ולהגיב לאירועים במהירות".
