צעד מעורר מחלוקת של ראש הממשלה בנימין נתניהו הוביל לביטול מינויו של הרב אבישי טהרני לראש מערך הגיור, חרף זכייתו במכרז פומבי וחד-משמעי. במקומו, נותר בתפקיד הרב יהודה עמיחי, מועמדו של שר האוצר בצלאל סמוטריץ', שהפסיד בהתמודדות, כך דווח בגלי צה"ל.
גורמים במשרד המשפטים טוענים כי ההחלטה התקבלה משיקולים פוליטיים בלבד. "מדובר בשיקולים פוליטיים, זו בעיה", אמרו. "למרות שמדובר במכרז פומבי שמחייב בחירה מקצועית – הפוליטיקה שוב ניצחה".
על פי דיווחים, סמוטריץ' סיכם עם נתניהו בתחילת התהליך כי מערך הגיור יישאר בשליטת הציונות הדתית. אולם, מועמדו הפסיד במכרז, וטהרני נבחר פה אחד. חרף זאת, נתניהו ביטל את התוצאה והשאיר את עמיחי בתפקיד.
הרב יצחק פרץ, ראש מערך הגיור לשעבר, תקף את החלטת ראש הממשלה: "ביטול בחירתו כדין של הרב טהרני לראש מערך הגיור הינו צעד קיצוני, עושה עוול לבאים בשערי בתי הדין לגיור שמשוועים למערך מתפקד".
