במהלך יום הכיפורים, במבצע מורכב שנמשך כ-12 שעות בלב ים, סיכלו לוחמי חיל הים ניסיון חדירה נרחב של "משט סומוד". המשט, שהוגדר על ידי חיל הים כ"חסר תקדים", כלל 41 כלי שיט ועליהם מעל 400 מפליגים, שהצהירו על כוונתם לפרוץ את הסגר הימי החוקי על רצועת עזה. בפעולה השתתפו מאות לוחמים מכוחות מגוונים של חיל הים, ובהם שייטת 13, שייטת 3, לוחמות סנפיר ויחידות לוחמות נוספות.
טרם העלייה לכלי השיט (בורדינג), קראו הלוחמים אל עבר המפליגים בבקשה שיסתובבו. אולם, כלי השיט התנגדו לבקשה, ורק לאחר מכן בוצעה ההשתלטות. המבצע התנהל בפיקודו של מפקד חיל הים, אלוף דוד סער סלמה, שפיקד על הכוחות מלב ים.
ואכן, במיקום ובשעה שנבחרו מראש, ובתזמון מדויק, לוחמי שייטת 13 השתלטו על שש הספינות המובילות של המשט במקביל: "סירוס", "אלמה", "ספקטרה", "הוגה", "אדרה" ו"דיר יאסין". כתוצאה מכך, בתוך שעה מתחילת המבצע, הושגה שליטה מבצעית על כל ששת הכלים הגדולים.
במהלך מבצע ההשתלטות הבוקר, חוו הפעילים תקלה דרמטית כאשר אחת הספינות של המשט החלה לשקוע כתוצאה מתקלה טכנית. לפיכך, הפעילים שעל הסיפון חולצו בבטחה מלב ים על ידי כוחות חיל הים הישראלי. בסיום הפעולה, החלו בהעברת כל סירות המשט לנמל אשדוד – לאחר שהתקבלה ההחלטה שלא להטביע אותן בלב ים ויותר מ-400 המפליגים הועברו לנמל, שם יחל הליך הטיפול בהם על ידי הרשויות.
ראש הממשלה בנימין נתניהו אמר עם צאת יום הכיפורים כי הוא "משבח את חיילי ומפקדי חיל הים שביצעו את פעילותם במהלך יום הכיפורים באופן המקצועי והיעיל ביותר. פעילותם החשובה מנעה כניסה של עשרות כלי שיט לאזור המלחמה והדפה מסע דה-לגיטימציה נגד ישראל".
שר הביטחון ישראל כ"ץ שיגר "ברכות לצה"ל ולכלל גופי הביטחון על ביצוע מופתי בעצירת ונטרול משט הטרור לעזה". כ"ץ ציין כי זו "מלאכת קודש בעיצומו של היום הקדוש – למען ביטחון מדינת ישראל".
