מערכת הביטחון בישראל מצויה בדריכות שיא לנוכח הדיווחים הגוברים על מזכר הבנות מתגבש בין ארצות הברית לאיראן, כאשר ברקע מרחפת האפשרות להכרזה דרמטית בטווח הזמן המיידי. על פי דיווחים שפורסמו בתקשורת הערבית, בפרט ברשת "אל-חדת'" הסעודית, "הכרזה על הסכם תיתכן תוך שעות", זאת בשעה שגורמים פקיסטנים מסרו לסוכנות הידיעות רויטרס כי תגובתה הרשמית של וושינגטון להצעת טהרן צפויה להתקבל כבר ביממה הקרובה.
החשש המרכזי במערכת הביטחון הישראלית נובע מהסעיפים המסתמנים בטיוטה, שעל פי הערכות גורמי צבא אינם כוללים מענה לאיומים המבצעיים הקריטיים. בצה"ל מתריעים כי ההסכם הנוכחי לא צפוי לכלול הפסקה של העשרת האורניום, וכי הוא נעדר התייחסות למאמצי הפיתוח של איראן בתחום הטילים הבליסטיים. גורמים בצה"ל מעריכים כי המשטר בטהראן נוקט באסטרטגיית משיכת זמן מכוונת, במטרה להוביל לנסיגת נושאות המטוסים האמריקניות מהאזור, כל זאת בעוד ישראל שומרת על כוננות עליונה למקרה שהמגעים יעלו על שרטון והלחימה תתלקח מחדש.
התחושה בירושלים קשה, ומתומצתת היטב בדבריו של גורם ביטחוני המכיר את הזירה האיראנית לעומק, שאמר בשיחה עם "ויינט": "אם נכנסת עם האיראנים לחדר המו"מ – הפסדת". החשש בישראל הוא מפני "הסכם רע" שיעניק לאיראן אורך נשימה לשקם את יכולותיה הגרעיניות והטיליות, ובכך יחסום את האפשרות להפלת המשטר על ידי עמו. מעבר לסכנה המידית, קיימת דאגה אסטרטגית לטווח הארוך: החשש הוא כי בעוד כשנתיים, עם חילופי ממשל פוטנציאליים בבית הלבן או שינוי באקלים הפוליטי בארה"ב, ישראל עלולה למצוא את עצמה מול שוקת שבורה. בתרחיש כזה, ישראל עלולה להיתקל באמברגו חימוש ומניעת חלקי חילוף אם תבקש לפעול באופן עצמאי נגד איום איראני מתחדש, דבר שיותיר אותה עם "Don't מדיני מהבהב".