למעלה משנתיים וחצי לאחר שניצב בדימוס אמנון אלקלעי התלונן על כך שהמפכ"ל לשעבר קובי שבתאי דקר אותו בסכין, החליטה היועצת המשפטית לממשלה, גלי בהרב-מיארה, לסגור את התיק הפלילי באופן סופי. התקרית המדוברת, שהתרחשה במהלך דיון רגיש בבית הספר לשוטרים, עוררה בשעתו הדי ענק והובילה לחילוקי דעות קשים בין המעורבים סביב השאלה האם מדובר בפגיעה מכוונת או שמא בתאונה בלתי צפויה שהשתבשה.
על פי הדיווח ב-i24NEWS. אלקלעי טען כי שבתאי דקר אותו ברגלו בתאריך 20 ביוני 2023, בעיצומו של הדיון המשותף. מנגד, גרסתו של שבתאי לאורך כל הדרך הייתה שונה לחלוטין; המפכ"ל לשעבר טען בתוקף כי שלף את הסכין אך ורק על מנת לחתוך פרי, וזו נשמטה מידו במקריות ופגעה ברגלו של אלקלעי שישב בסמוך אליו. אלקלעי, שפונה בעקבות האירוע לקבלת טיפול רפואי בבית החולים הדסה, סירב לקבל את גרסת הנפילה ועמד על דעתו כי הדקירה בוצעה באופן מכוון.
ממצאי הבדיקה מעלים כי בעת התרחשות המקרה, אלקלעי חש מבוכה רבה להגיש את התלונה הרשמית ולא רצה לפגוע במעמדה של המשטרה, אך לבסוף שינה את דעתו והחליט שכן לעשות זאת בשל מה שהגדיר כ"התגנהגותו הפזיזה" של שבתאי באותה העת. מח"ש מצידה פעלה במהירות מרבית וסיימה את הליכי החקירה בתוך עשרה ימים בלבד, תוך שהיא מעבירה המלצה ברורה ליועמ"שית לסגור את התיק. למרות זאת, בלשכת היועצת המשפטית לממשלה העניין התעכב במשך יותר משנתיים תמימות, עד אשר התקבלה ההכרעה הרשמית בימים אלו.
העיכוב הממושך בקבלת ההחלטה בלשכת היועמ"שית לא עבר בשקט, וגרר תגובה תקיפה ויוצאת דופן מצד מוסד הביקורת. נציב התלונות על מייצגי הציבור בערכאות ביקר בחריפות את היועצת וכתב בדוח מיוחד כי: "תיק בעל רגישות ציבורית טופל פרק זמן שאינו מתקבל על הדעת, ללא הצדקה מספקת. ניתן וראוי היה לקצר באופן משמעותי את משך זמן הטיפול בתיק על ידי היועצת המשפטית לממשלה ולשכתה, ובכך למנוע הותרת תיק פלילי פתוח משך זמן ארוך ביותר נגד מפכ"ל מכהן".
