בניגוד לעמדת הדרג המקצועי ופרופ' רוני גמזו, הממשלה אישרה: סגר מלא מיום שישי למשך שבועיים,
שר האוצר ישראל כ"ץ הצביע נגד החלטת הממשלה להטיל סגר הדוק על המגזר בפרטי: "ניתן היה לקדם צעדים לבלימת המחלה מבלי לפגוע פגיעה אנושה במפעלים ועסקים במגזר הפרטי, חוסנה הכלכלי של מדינת ישראל הוא חלק מהחוסן הלאומי ויש לשמור עליו"
נתניהו אמר: ביקשתי לדעת מה היה שיעור ההדבקה בגל הראשון. מה שיש עכשיו זה כפול. אני אומר לכם – תתעוררו. אם אתם חושבים שאתם יכולים להמשיך בשגרה אני חושב שזה הזוי. אין דבר כזה בעולם, תתעוררו, אנחנו לא נוכל להמשיך כך. יהיה לזה מחיר, אבל המחיר של לא לעשות את זה – זה טירוף הדעת. צריך לקבל את ההחלטות האלה
במהלך הישיבה נרשם עימות על התפילות בבתי הכנסת השר זמיר טען: "אז למה לפתוח בתי כנסת ביום כיפור?" נתניהו השיב "יש אנשים שיהיה להם קשה לעמוד בחום" דרעי הסביר: "אין אכיפה יותר טובה מהאכיפה של הרבנים, הצלחנו בסגר הקודם בגלל הקריאה של הרבנים. זו הצעה מאוזנת – זה יום אחד בשנה ואחר כך נסגור"
השר אשכנזי סיכם: אני חושב שאריה הציג בצורה מאוזנת את הדברים. זה (בתי כנסת ביום כיפור) אירוע חריג ונכון להחריג אותו
:
בסופו של דבר הוכרע:
● סגר מלא והרמטי מיום שישי בצהריים למשך שבועיים.
● הפגנות ותפילות יותרו בחוץ עד 1 ק"מ מהבית וקפסולות של עד 20 איש.
● תהיה חובת מרחק של 2 מטר זה מזה. לא יהיו מגבלות על ספורט יחידני.
● נתב"ג ייסגר לטיסות יוצאות למעט חירום (כנראה).
● ביום כיפור תותר תפילה מצומצמת בתוך בתי כנסת לפי מתווה שמשרד הבריאות יגבש.
● המשק ייסגר לגמרי למעט מפעלים חיוניים וזאת בניגוד לסגר מרץ-אפריל שאז פעל במתכונת של 30 אחוז.