בבדיקה תקופתית שנערכה במערכות המים של בית הנשיא נמצאה כמות חריגה של זיהום וחיידקים במים, ועלה חשש להימצאות חיידק הלגיונלה במי בית הנשיא ובדירה של הנשיא הרצוג ורעייתו מיכל. ריכוז גבוה של החיידק במים עלול לגרום לצורה של דלקת ריאות שמכונה "מחלת הלגיונרים", ולכן השימוש במים בבית הנשיא נאסר. היום ייערך מבצע מיוחד לחיטוי הצנרת.
כבר תקופה ארוכה שהעובדים בבית הנשיא מתלוננים שהמים עכורים, צבעם חום ולעיתים טעמם מתכתי. בעיתון "ידיעות אחרונות" פורסם מייל פנימי שהנהלת בית הנשיא הוציאה לעובדים: "בעקבות ממצא חריג שעלה במסגרת דיגום המים בדירת נשיא המדינה, ספק חברת הניהול יבצע חיטוי לכלל הצנרת של בית הנשיא תוך הקפדה על מילוי הוראות משרד הבריאות, כולל ניקוז מלא של המאגר, קרצוף כל שטחי המאגר וחיטוי באמצעות כלור נוזלי. לאור הטיפול הנ"ל, נבקש שלא לשתות מברזי המשכן במהלך יום שישי. יחולקו למקרה הצורך בקבוקי מים מינרליים".
מבית הנשיא נמסר בתגובה: "בשל בעיית תשתיות מיושנות ולקויות, אחת לתקופה נערכת בבית הנשיא בדיקה תקופתית על מנת לבדוק את רמת זיהום המים. בבדיקה האחרונה שנעשתה התגלתה כמות חריגה של זיהום. בעקבות כך, הוחלט לקיים הליך חיטוי לכלל הצנרת".
