מעט לאחר השעה 17:30 הגיע מחבל לשער הכותנה בעיר העתיקה בירושלים משטח הר הבית כשהוא חמוש בסכין, שלף אותו והסתער לעבר שני שוטרים של מחוז ירושלים ומג״ב שפעלו במקום.
בתגובה השוטרים השיבו בירי לעברו והוא נוטרל. כתוצאה מהפיגוע, נפצעו שני שוטרים באורח בינוני ופונו לקבלת טיפול רפואי בבתי החולים הדסה הר הצופים ושערי צדק בעיר.
בהמשך נקבע מותו של המחבל, פלסטיני מיו״ש בשנות העשרים לחייו. כוחות משטרה גדולים הוזעקו למקום והחלו באיסוף ממצאים וראיות מזירת הפיגוע.
בשעה האחרונה התקיימה הערכת מצב מיוחדת בראשות מפכ״ל המשטרה רב ניצב יעקב שבתאי, מפקד מחוז ירושלים ניצב דורון תורג׳מן ומפקד משמר הגבול ניצב אמיר כהן בדבר הפיגוע, והמשך ההיערכות והפעילות המבצעית במקום.
