אחרי מחלוקת קשה שמעיבה על הממשלה כולה מרגעי הקמתה בנוגע לסמכיותיו של שר האוצר והשר במשרד הביטחון בצלאל סמוטריץ' בכל הקשור למנהל האזרחי והשליטה ביו"ש, לבין שר הביטחון יואב גלנט שסירב לשחררם, מה שהוביל לכמעט פיצוץ בלתי הפיך וביתר שאת עם פינוי הכרם בשילה בשבוע שעבר, היום הגיעו השניים להסכמות בתיווכו של ראש הממשלה.
לפי דיווח של 'בערוץ 12' רוב הסמכויות יישארו בסופו של דבר בידי שר הביטחון, לו גם תהיה זכות ווטו על כל החלטה בנעשה ביו"ש. סמוטריץ' יקים מנהלת במשרד הביטחון שתאפשר לו בקרה על הנעשה וגם יוכל למנות סגן אזרחי למפקד המנהל האזרחי.
המבנה הארגוני של המנהל האזרחי ביו"ש יישמר כמו שהיה עד כה, למעט מינוי הסגן האזרחי. גם בנושאי מינויי הקצינים, הדבר יישאר בסמכות הרמטכ"ל. בכל הנוגע לאכיפת הבנייה ביו"ש, כולל פינוי מאחזים הסמכויות יישארו בידיו של שר הביטחון בלבד ובכל מחלוקת על פעולה לה יש השלכות ביטחוניות, תהיה לשר גלנט זכות ווטו.
ההישג המרכזי של השר סמוטריץ' הוא הקמת מנהלת חדשה בתוך משרד הביטחון בראשה יעמוד מנכ"ל מועצת בנימין לשעבר, יהודה אליהו. בנוסף, סמוטריץ' ימנה סגן אזרחי למנהל האזרחי ביו"ש שיהיה אחראי על כל הסוגיות האזרחיות והוא יהיה כפוף לשני השרים.
