הודעתו של שר הביטחון ישראל כ"ץ על מינויו הצפוי של האלוף דדו בר כליפא למפקד פיקוד המרכז עוררה סערה חריגה בצמרת מערכת הביטחון. זמן קצר לאחר דבריו של כ"ץ בתוכנית "הפטריוטים", פרסם דובר צה"ל הודעה חריפה שלפיה הדברים כלל לא תואמו עם הרמטכ"ל.
בדובר צה"ל הבהירו כי: "דברי שר הביטחון לא תואמו עם הרמטכ״ל. האלוף אבי בלוט מפקד על פיקוד המרכז במציאות מורכבת, במקצועיות, באומץ ובהקרבה והוא זוכה לאמון מלא. אין בכוונת הרמטכ״ל להחליף מפקדים בתפקידי מפתח בתקופה רגישה זו ואחת שתלקח החלטה כזו על ידי הרמטכ״ל היא תאושר בהתאם לנהלים."
הודעה זו הינה חריגה במיוחד, שכן מדובר בהודעה פומבית של הרמטכ"ל באמצעות דובר צה"ל, נגד שר הביטחון הממונה על הרמטכ"ל וצה"ל. בתגובה לפרסום החריג של דו"צ, פרסמה לשכת שר הביטחון הודעה מפורטת שבה דחתה את הטענות והבהירה כי הליך המינוי החל כבר לפני חודשים, בעקבות המלצתו של הרמטכ"ל.
מלשכת השר נמסר: "כבר בסוף חודש אפריל המליץ הרמטכ”ל, רב-אלוף אייל זמיר, לשר הביטחון ישראל כ״ץ למנות את אלוף דדו בר כליפא למפקד פיקוד המרכז, ואף ביקש ממנו לראיין אותו לתפקיד. שר הביטחון קיים עם בר כליפא ראיון אישי במהלך חודש יוני, התרשם כי הוא המועמד המתאים ביותר לפקד על פיקוד המרכז, והחליט כעת להודיע על קבלת המלצת הרמטכ״ל ועל המינוי הצפוי בסבב המינויים הבא".
עם זאת, בלשכה הוסיפו וסנטו בבלוט: "מדיניות שר הביטחון היא לקדם בצה״ל מפקדים בעלי רקורד מוכח של התקפיות והצלחות במלחמת התקומה, בהתאם למדיניות הביטחון אותה מוביל שר הביטחון יחד עם רה״מ בנימין נתניהו."
