בית המשפט העליון בשבתו כבג"ץ פרסם הודעת גינוי חריפה, פומבית ויוצאת דופן, בתגובה להכרזת הממשלה שלשום כי בכוונתה להחרים ולא לציית לפסיקת בג"ץ בעניין מועצת הרשות השנייה.
בהודעתו הרשמית, הציב בית המשפט תמרור אזהרה משפטי חמור וישיר בפני הדרג הפוליטי והמבצעי וקבע: "עובדי ונבחרי ציבור צריכים לפעול אך ורק לפי הוראות הדין. ככל שלא יעשו כן, הם עשויים לשאת באחריות נזיקית אישית על השלכות מעשיהם".
כדי להמחיש את חומרת המצב, שופטי בג"ץ בחרו לצטט בהודעתם פסיקת עבר נוקבת המזהירה מפני קריסת הדמוקרטיה והסדר הציבורי במדינה, שבה נכתב: "מדינה שבה רשות שלטונית נוטלת את החוק לידיה, וברצותה מכבדת צו שיפוטי שניתן לה וברצותה מתעלמת ממנו – היא מדינה שנזרעים בה זרעי פורענות ואנרכיה".
הרקע לסערה החל שלשום, כאשר שר המשפטים יריב לוין ושר התקשורת שלמה קרעי שיגרו הודעה רשמית ומתריסה בשם הממשלה, ובה הצהירו בגלוי על מרד חוקתי. "הממשלה לא תכיר בכל החלטה, אישור, מינוי או פעולה שתבצע מועצת הרשות השנייה, כל עוד אינה עומדת בתנאי הסף המפורשים שנקבעו בחוק", כתבו השרים בצעד שזעזע את המערכת הציבורית.
מקור המחלוקת נעוץ בפסיקה דרמטית של בית המשפט העליון בה החזירו השופטים לפעילות שוטפת את מועצת הרשות השנייה שמונתה בתקופת הממשלה הקודמת, וזאת למרות שמספר חבריה המכהנים בפועל צנח אל מתחת לרף המינימלי הנדרש והקבוע בלשון החוק.
לטענת השרים לוין וקרעי, השופטים חרגו מסמכותם: "הממשלה קבעה כי שלטון החוק מחייב את כל רשויות השלטון ובכלל זה את בית המשפט. פסיקה הסותרת באופן חזיתי את לשונו הברורה של החוק אינה יכולה להקנות סמכות שלא קיימת בחוק, ולכן הממשלה לא תכיר בפעולות שייעשו מכוחה". אם לא די בכך, השרים שיגרו איום ישיר לעבר שוק התקשורת הפרטי והצהירו כי הממשלה לא תאפשר לגורמים מסחריים להישען על החלטות המועצה, ולא תישמע כל טענה של "מעשה עשוי" מצד גופי השידור שיפעלו תחת הנחיות הרשות השנייה – החלטה שעלולה לשתק לחלוטין את שוק התקשורת בישראל.