הפרשה שנחשפה בשבוע שעבר בקלקיליה נמשכת: בית המשפט הצבאי שומרון האריך בשמונה ימים את מעצרם של שני תושבי קלקיליה, שנעצרו בפעילות משטרת מחוז ש"י ולוחמי מג"ב איו"ש בחשד לעבירות ביטחוניות חמורות. במקביל, מעצרם של שני האזרחים הישראלים שנעצרו בפרשה הוארך אף הוא, והחקירה במשטרה נמשכת.
הפעילות התקיימה ב־23 בספטמבר, במסגרת פעילות מודיעינית של היחידה ללוחמה בפשיעה במרחב שומרון יחד עם לוחמי מג"ב איו"ש. במהלך הפעילות נעצרו ארבעה חשודים, שני אזרחים ישראלים ושני תושבי קלקיליה. בהמשך הוזעקו למקום גם כוחות מחטיבת שומרון וצוותי יהל"ם של צה"ל.
החשודים הועברו לחקירת המשטרה בחשד, בין היתר, להחזקת אמצעי לחימה, קשירת קשר לביצוע פשע, הכנה לביצוע מעשה טרור, הכשרת דרך מעבר או מנהרה לשם ביצוע עבירה או לשם הימלטות לאחר ביצועה, החזקה או אחסנה של חומר בלתי מאושר ועבירות נוספות.
שני החשודים הפלסטינים הובאו אמש לבית המשפט הצבאי שומרון, שנעתר לבקשת המשטרה והאריך את מעצרם בשמונה ימים נוספים, עד 4 באוקטובר, לצורך המשך החקירה. מעצרם של שני החשודים הישראלים הוארך כבר ביום חמישי האחרון, עד 29 בספטמבר.
המעצרים בוצעו על רקע פעילות שבה דיווחה המשטרה בשבוע שעבר על איתור תוואי חפירה עמוק בקלקיליה, לצד אמצעי לחימה וחומרים נוספים. לפי הדיווח הראשוני של המשטרה, במקום אותרה מנהרה בשלבי חפירה שעומקה כ־25 מטרים לפחות, וכן תחילתה של חפירת מנהרה נוספת. בחיפוש נתפסו, בין היתר, נשק מסוג M16, רובה צלפים, תחמושת, מחסניות, טלפונים, דשן המשמש להכנת מטענים ומכשיר DVR.
אלא שבהמשך נוצר פער בין גרסת המשטרה לבין ממצאי הבדיקה הצבאית: צה"ל מסר כי לוחמי יהל"ם בדקו שני פירים בעומק של כ־12 מטרים, ובתום הבדיקה נשלל קיומו של תוואי מנהרה בפירים. לצד זאת, אותרו בסמוך להם אמצעי לחימה ובהם רובה M16, רובה ציידים, אקדח ותחמושת.
כעת, עם הארכת מעצרם של שני תושבי קלקיליה, החקירה נמשכת והמשטרה ממשיכה לבדוק את החשדות המיוחסים לארבעת העצורים ואת הקשר ביניהם, כאשר בשלב זה מדובר בחשדות שטרם התבררו במסגרת ההליך המשפטי.