לא רק במלונות, ובאולמות השמחות, גם הכוללים נערכים לדרישה נחרצת מהאברכים להתחסן נגד הקורונה, ואף יודיעו לקראת זמן קיץ הקרוב על מתווה מיוחד עבור מי שאינו מתחסן נגד הקורונה, ולפי איך שזה נראה כעת – זה לא יהיה פשוט ללמוד בכולל ללא דרכון ירוק
גם בכוללים תופעל שיטת המקל והגזר, בשלב הראשון ראשי הכוללים ברחבי הארץ קוראים לציבור האברכים ללכת ולהתחסן כהוראות גדולי הדור
במכתב שפרסמו ברשתות הכוללים קוראים בימים האחרונים ראשי הכוללים ללכת ולהתחסן על מנת להחזיר את החיים לקדמותם ולמנוע ביטול תורה עצום שכבר היה במשך השנה החולפת בגלל הבידודים והסגרים
השלב השני ישלב גם 'מקל', ברשת הכוללים "עטרת שלמה" בראשות הגרש"ב סורצקין הודיעו לאברכים כי מי שיעדר בזמן קיץ מחמת בידוד או הידבקות בקורונה היעדרותו תקוזז מהמלגה מאחר ולא התחסן
גם בכולל הגדול של הגרי"מ דרוק בגבעת שאול קוראים תחילה להתחסן כפי הוראת נשיא מוסדות מרן שר התורה הגר"ח קניבסקי
"אברך שיימנע מליטול את החיסון, ומחמת כן ייאלץ בזמן קיץ הבעל"ט להיעדר מן הכולל עקב בידוד וכדו', ישא באחריות על כל המשתמע מכך." כתב הגרי"מ דרוק תלמידו המובהק של מרן שר התורה הגר"ח קניבסקי
הגרי"מ דרוק גם קרא למי שביכולתו לשכנע ולפעול שאחרים להתחסן זכות גדולה בידו להעמדת קרן התורה
יודעי דבר אמרו כי גם בכולל של הגרי"מ דרוק יודיעו כי אברך שלא מתחסן נגד הקורונה ייאלץ להראות בדיקת קורונה שלילית מידי יום ביומו
עוד נודע כי ישנם כוללים שיחמירו אף יותר ולא יקבלו כלל אברכים שלא יתחסנו "שילמדו בבית ויקבלו רק תקציב דתות, האישורים של תוצאות שליליות לא יחשבו משהו אמין כמו חיסון או תעודת מחלים"
אברך מכולל גדול במודיעין עילית אומר ל'המחדש': ברגע שגדולי הדור הורו להתחסן, הכל יעבוד לפי ההוראה הזו, אברך שמאמין לפייק ניוז וסיפורים – שילמד בבית ויתכן ויקבל את תקציב הדתות, המטרה היא לחזור לשגרה כמה שיותר מהר, ולמנוע את ביטול תורה. מיליונים בעולם קיבלו את החיסון, אם המדינה תאפשר למחוסנים ללמוד כרגיל זה כבר סיבה להתחסן ולצאת מהסיבוך הזה"
האברך מרגיע ואומר כי "לא מדובר בהרבה אברכים כי 80% או חלו או התחסנו"