בכירי צה"ל, כולל הרמטכ"ל וקצינים בכירים בצה"ל, הוציאו אזהרה חמורה לדרג המדיני המורכב מראש הממשלה ושרים בקבינט המלחמה, מפני סחרור מסוכן כלפי מטה ביהודה ושומרון, שעלול להסתיים בעימות בעצימות גבוהה נוסף שישראל תצטרך להתמודד איתו.
בפגישות פרטיות עם ראש הממשלה והשרים, הביעו בכירים ביטחוניים את דאגותיהם ואמרו: "יהודה ושומרון על סף פיצוץ. אנחנו עלולים להגיע שם לאינתיפאדה שלישית בגלל המהומות שנגרמות מהקושי הכלכלי ומאי הכנסת העובדים לישראל".
חשש זה משותף גם לארגוני ביטחון אחרים, כולל השב"כ. שורש הדאגה נובע מהחלטתו של נתניהו לא לאפשר למספר משמעותי של פועלים פלסטינים להיכנס לישראל, כמו גם מסירובו של שר האוצר בצלאל סמוטריץ' להעביר כספים לרשות הפלסטינית.
מערכת הביטחון וצה"ל בפרט צופים שמערבולת כלכלית זו תוביל בסופו של דבר לפיצוץ אלים. הם דוחקים בנתניהו לכנס דיון ייעודי בנושא ולקבל החלטות שמטרתן למנוע גיהינום פוטנציאלי באזור נפיץ ממילא. בכירים בממשל האמריקאי שותפים לעמדה הזו ומבקשים מישראל להפחית את המתיחות ביהודה ושומרון. עם זאת, ראש הממשלה טרם קיבל החלטה בנושא, בעיקר בשל לחצים פוליטיים מצד שותפיו לקואליציה.
