בכירים בחיל האוויר מתחו ביקורת על התנהלות הצמרת המדינית סביב הפעלת מטוס "כנף ציון", אותה הם מגדירים כשגויה.
כיום פועלת טייסת ייעודית בחיל האוויר לקליטת המטוס בבסיס חיל האוויר בנבטים והטייסים אף יוצאים לאימוני סימולטורים באיסלנד אולם בדרג הפוליטי קיים ויכוח האם להפעילו מחשש למראית עין.
"מדינת ישראל, בגיל 74 ולאור מעמדה בעולם ומצבה הבטחוני, צריכה מטוס לראשי המדינה", אמר בכיר בחיל האוויר לכאן חדשות. "אנחנו רואים איך כל המדינות מתנהלות וזה משהו שהוא חלק מהצד החיובי של סמלי השלטון שנשיא מגיע לביקור רשמי והוא לא יורד ממטוס של חברה אזרחית-מסחרית אלא ממטוס ממשלתי עם סמל מדינת ישראל".
"זה נכון להשקיע בזה. חיל האוויר ערוך לקליטת המטוס מהרגע שנתנה הנחיה, הכשרנו אנשים והתכוננו לרגע שבו המטוס יגיע אל החייל".
בחיל האוויר אמרו כי יש לבחון בעתיד את דרך קבלת ההחלטה להטיל את מלאכת הרכבת המטוס על ידי התעשייה האווירית בעתיד וגם את דגם המטוס שנבחר, אולם כעת לאחר שהמטוס כבר עובדה קיימת הגורם טוען כי ראוי להפעילו. "צריך לתחקר את דרך קבלת ההחלטות, אבל ראוי שיהיה מטוס", הוסיף הבכיר.