שבוע וחצי אחרי העימותים האלימים בהלווייתה של העיתונאית שירין אבו עאקלה, בחדשות הערב נחשף היום (שלישי) על מחלוקת בין שב"כ למשטרה סביב ההתנהלות באירוע. שב"כ התריע לפני האירוע כי יש לאפשר את התהלוכה. אך למרות זאת במשטרה בחרו לפזר אותה בכוח בשטח. כך דווח ב'כאן 11'
משב"כ נמסר בתגובה כי "שב״כ ומשטרת ישראל פועלים בשיתוף פעולה הדוק אשר מביא להישגים רבים למען ביטחון המדינה. איננו מתייחסים לנאמר בדיונים סגורים".
פיזור התהלוכה הוביל לעימותים קשים בין המשטרה ומשתתפי ההלווייה, ואף לגינויים בין לאומיים. בעקבות האירוע, הנהלת בית החולים הצרפתי שבו התקיימו העימותים הצהירה שבכוונתה להגיש תלונה נגד המשטרה ומדינת ישראל לבתי משפט בארץ ובחו"ל. מיד לאחר האירוע המפכ"ל והשר לביטחון הפנים הקימו צוות חקירה שיבדוק את התנהלות המשטרה ויציג ממצאים בתוך ימים ספורים – אך עד כה הם לא פורסמו.
ממשטרת ישראל נמסר: "משטרת ישראל ושב״כ פועלים בשיתוף פעולה מלא למען ביטחון המדינה וכך היה גם במקרה זה. המשטרה נערכה ופעלה לקיום הלוויה בתיאום ושיתוף פעולה הדוק גופי הביטחון ובני משפחת המנוחה. לצערנו במהלך הלוויה החלו הפרות סדר אלימות שכוונו כלפי שוטרים שפעלו לקיומה כחוק ותוך שמירת הסדר. נציין כי ההמלצה המתוארת אינה מוכרת לנו וממילא איננו מתייחסים לנאמר בדיונים סגורים".
בתוך כך רשת CNN מפרסמת הערב (שלישי) תחקיר לפיו, העיתונאית של רשת אל-ג'זירה שירין אבו-עאקלה נהרגה מירי של כוחות צה"ל ולא של פלסטינים. ממצאי התחקיר מתבססים על סרטונים חדשים מהזירה שהגיעו לידי רשת הטלוויזיה האמריקנית, עדויות של 8 עדי ראייה ומומחה לזיהוי פלילי.
על פי התחקיר, אבו עקלה, פלסטינית-אמריקנית בת 51, הגיעה בסביבות השעה 6:30 בבוקר למחנה הפליטים כדי לסקר פעילות של צה"ל במקום. היא עמדה בכניסה למחנה יחד עם עיתונאים נוספים, כולם לבשו אפודי מגן בצבע כחול שזיהה אותם כאנשי תקשורת.
"עמדנו מול כלי הרכב של צה"ל כ-5 עד 10 דקות לפני שהתקדמנו כדי להיות בטוחים שהם ראו אותנו", סיפרה ל-CNN שאטה הנאיישה, עיתונאית פלסטינית שהייתה חלק מהקבוצה. "זה חלק מההרגל שלנו כעיתונאים, אנחנו זזים כקבוצה ועומדים מולם כדי שהם יידעו שאנחנו עיתונאים – ואז אנחנו מתחילים לזוז".