לוחמי שייטת ספינות הטילים (שייטת 3) של זרוע הים משתפים פעולה באופן הדוק עם כוחות חיל האוויר במשימת ההגנה.
במהלך הלחימה, הלוחמים ביצעו מספר יירוטים מוצלחים במספר זירות שביניהם גם היירוט המבצעי הראשון של ספינות סערי ה-6 בזירת ים סוף מאז הגעתן למדינת ישראל.
מערכות ההגנה הימיות אשר מותקנות על גבי ספינות הטילים מהוות מכפיל כח משמעותי לכוחות בשטח.