הפרקליטות האשימה את תושב שכם בעבירה חמורה של "ניסיון גרימת מוות בכוונה בצוותא", כך נודע מפרסום ראשון בכאן 11. האיש, אחיו של מי שהניח את מטעני החבלה באזור בת ים, היה לפי הנטען שותף משמעותי במזימה שיכלה להסתיים באסון כבד.
פרטי האישום חושפים תמונה מדאיגה של מעורבות האח בשלבים מוקדמים של התכנון. כבר בחודש ינואר, האח נחשף לתוכניות כאשר המפגע הציג בפניו את בלוני החמצן שרכש לצורך יצירת המטענים. בהמשך, ביקש ממנו המפגע לסייע ברכישת שלטים להפעלה מרחוק של המטענים, דבר המעיד על מעורבות אקטיבית בהכנות.
נקודה מטרידה במיוחד העולה מכתב האישום היא העובדה שהמפגע נעצר בישראל זמן קצר לפני שהניח את המטענים, אך שוחרר. למחרת שחרורו, המשיך בביצוע התוכנית והניח את מטעני החבלה.
החקירה חשפה גם כי בין האחים התקיימה שיחת וידאו שבמהלכה תיעד המפגע את שהותו בדירה בישראל והצביע על תיק הגב שבו הוסתר המטען. בשיחה זו ציין המפגע כי הוא שוהה בדירה עם פועלים נוספים, והאח הבין שהמטענים מוסתרים מתחת למיטה בדירה. פרט טכני נוסף שנחשף בחקירה הוא שהמטענים תוכננו לפעול באמצעות שעונים מעוררים שנרכשו והוסבו במיוחד למטרה זו.
הפיגוע עצמו התרחש כאשר המפגע הניח כארבעה מטעני נפץ באוטובוסים בסביבות השעה 20:00, במקומות הסמוכים לבת ים ותל אביב. לפי התכנון המקורי, המטענים היו אמורים להתפוצץ בשעות הבוקר, ככל הנראה במטרה להגדיל את מספר הנפגעים. מיד לאחר הנחת המטענים, התקשר המפגע לאמו ולאחיו וביקש את סליחתם, מה שמחזק את ההערכה לגבי חומרת הכוונות.
פרטים מצמררים נוספים שהתגלו בחקירה נוגעים לסימונים על המטענים: על מיכלי החמצן שמהם הוכנו נכתבו שמותיהם של מחבלי טרור, ואילו על המטענים עצמם הופיעו שמות ערים בישראל, מה שמרמז על תכנון מוקדם וכוונה ברורה לפגוע באזרחים ישראלים.