צה״ל ושב״כ מאשרים את הדיווחים הפלסטיניים, לפיהם תקפו במהלך הלילה (א'), מתחם "בית ספר" ואומרים כי היעד לתקיפה היה "מחבלים מרכזיים ששהו במתחם פיקוד ושליטה של ארגוני הטרור חמאס וגא״פ שהוקם במרחב ששימש בעבר כבית ספר ‘פהמי אלג׳רגאוי׳ במרחב העיר עזה".
לטענת הפלסטינים, 25 הרוגים במקום ובצה"ל מציינים כי "מתחם הפיקוד והשליטה שימש את המחבלים לתכנון ואיסוף מודיעין במטרה להוציא לפועל פעולות טרור נגד אזרחי מדינת ישראל וכוחות צה״ל במרחב". כמו כן, "טרם התקיפה ננקטו צעדים רבים כדי לצמצם את הסיכוי לפגיעה באזרחים, לרבות שימוש בחימוש מדויק, תצפיות מהאוויר ומידע מודיעיני נוסף".
עוד נכתב בהודעת דובר צה"ל כי "ארגוני הטרור מפרים באופן שיטתי את הדין הבין לאומי, תוך ניצול אכזרי של מוסדות אזרחיים והאוכלוסייה כמגן אנושי לפעולות טרור. צה״ל ושב״כ ימשיכו לפעול בעוצמה ובנחישות נגד כל ארגוני הטרור ברצועה".
בלילה אין שם תלמידים בכל מקרה