משרד ראש הממשלה יצא במתקפה חריפה נגד דוח מבקר המדינה, אשר חשף כשלים חמורים בטיפול הממשלה בעורף וכינה אותו "בלתי רלוונטי" וחסר חשיבות. בתגובה רשמית שפרסם, טען המשרד כי הדוח מתעלם מההישגים ההיסטוריים של הממשלה ומכך שהמלחמה נפתחה ללא התראה מוקדמת ב-7 חזיתות. המשרד תקף גם את עיתוי פרסום הדוח, "ערב הכניסה וההשתלטות על העיר עזה", וטען כי הוא "תמוהה ומעלה סימני שאלה".
בתגובה מפורטת, משרד ראש הממשלה טען כי הדוח מתמקד ב"הערות שוליים חסרות חשיבות אמיתית" ומפספס את התמונה המלאה. המשרד הדגיש כי הממשלה התמודדה עם "מלחמה קיומית" שפרצה ללא התראה מוקדמת, והצליחה לפעול באופן מיידי. בתגובה הודגשו הישגים, בהם "הכאה קשה בחמאס ובחיזבאללה", "חיסול צמרת הנהגתם", "נפילת משטר אסד בסוריה", והסרת שני איומים קיומיים מאיראן: איום הגרעין והטילים הבליסטיים.
במקביל, התייחסה לשכת נתניהו גם לטיפול בעורף האזרחי, וציינה כי הממשלה הקצתה עשרות מיליארדי שקלים והקימה את מנהלות "תקומה" בדרום, "תנופה" בצפון ו"מנהלת חטופים". כראיה להצלחה, הוזכר כי 95% מתלמידי הצפון חזרו ללימודים ביישוביהם וכלכלת ישראל נותרה "עוצמתית", כאשר השקל התחזק, הבורסה בשיא וההשקעות מחו"ל זינקו.
מנגד, משרד מבקר המדינה הגיב למתקפה, ודחה את הטענות. בהודעה מטעמו הבהיר המשרד כי הדוח עוסק בפערים ובכשלים בניהול התחום האזרחי במלחמה. המבקר הדגיש כי הדוח משקף את איכות המענה שניתן לאזרחים וקרא לראש הממשלה לתקן את הליקויים.
"הדוח שפורסם היום מתמקד בניהול הממשלתי של התחום האזרחי במהלך מלחמת חרבות ברזל. תוצאות הפערים והכשלים בדוח זה באו לידי ביטוי באיכות המענה שסיפקה הממשלה לתושבי ישראל בשורה ארוכה של תחומים. על ראש הממשלה לפעול לתיקון הליקויים שפורטו בדוח. משרד מבקר המדינה מצוי בתהליכי ביקורות רבים בכל הנוגע לטיפול הממשלתי בתחומים האזרחיים, לצד ביקורות על ליבת הכשל שקדם לטבח 7.10. עם השלמתם הדוחות יתפרסמו לציבור.
מבקר המדינה וצוותי הביקורת ימשיכו במילוי תפקידם הציבורי חרף ההתקפה מצד ראש הממשלה, יו"ר האופוזיציה וגורמים מבוקרים אחרים בעת האחרונה. ביקורת על פעולתם של כלל הדרגים – המדיני, הצבאי והאזרחי, תימשך כפי שהודיע המבקר מהרגע הראשון".