בצל ההסלמה הביטחונית והיציאה למבצע "שאגת הארי", מערכת הבריאות בישראל נכנסה לישורת האחרונה של היערכות חירום נרחבת, תוך יישום לקחים מבצעיים מהעבר. המערכת החלה פעולתה במבצע כשהיא ברמת מוכנות גבוהה המבוססת על למידה מהמבצעים האחרונים – בדגש על מבצע "עם כלביא". לאור ההתפתחויות בגזרה הצפונית, נערך המשרד עוד לפני תחילת המלחמה לתגבור המענים בצפון, כאשר המטרה המרכזית היא להבטיח מענה רפואי איכותי וזמין לכל תושב בכל חלקי הארץ, בשגרה ובתחת אש.
כחלק מהיערכות מערכת הבריאות למערכה וביתר שאת מאז תחילתה, הורה מנכ”ל משרד הבריאות על העלאת מדרגת המוכנות של בתי החולים בצפון, בדגש על היערכות לאירועים רבי־-פגעים. ההערכות כוללת יתירות מתמדת במערכים הקריטיים בבתי החולים (חדרי ניתוח, מיטות טיפול נמרץ ועוד), תגבור כוח האדם הרפואי בבית החולים.
בנוסף קיים מודל תגבור חיצוני בין בתי החולים במסגרתו צוות מבית החולים כרמל מתגבר את המרכז הרפואי לגליל ומאיכילוב את בית החולים זיו, לצד הרחבת שירותים באזור. מאז מבצע עם כלביא התווספו למעלה מ-130 מיטות ממוגנות בבתי החולים זיו ונהריה (72 בזיו ו-60 בנהריה) וזאת לצד עתודה לאומית נוספת של מיטות ומערכים קריטיים ממוגנים בבית החולים רמב״ם.
במקביל, המשרד שם דגש מיוחד על המענה בעיר אילת בשל בידודה הגיאוגרפי. במסגרת זו תוגבר כוח האדם הרפואי הרלוונטי (כירורגים, מרדימים, טיפול נמרץ ורפואה דחופה) בבית החולים יוספטל והוגדל מערך האמבולנסים בטיפול נמרץ. בנוסף הופעלה תכנית "נצורה" לתגבור צוותים רפואיים, יכולת פריסת מיטות ואמצעים רפואיים מחוץ לבית החולים והיערכות להעברת צוותים נוספים לעיר במידת הצורך ותגבור על ידי גורמים רפואיים בצבא. בעיר אף הוצבה פלוגה כירורגית של צה״ל בסמוך ליוספטל, המסוגלת להפעיל אתר שהייה לפצועים במצב בינוני לפני פינויים למרכז.
בגזרת רפואת השגרה בקו העימות, משרד הבריאות, בשיתוף עיריית קריית שמונה והמרכז הרפואי רמב”ם, הרחיב את שירותי הרפואה בעיר במטרה לחזק את המענה הרפואי לתושבי קריית שמונה והאזור ברופאים מומחים לרפואה דחופה (ילדים ומבוגרים) לצד רפואת מומחים זמינה במידת הצורך על ידי הצוותים ברמב"ם. המוקד הרפואי הקדמי בעיר פועל כעת לאורך כל שעות היממה ובסופי השבוע, ותוגברו כוחות הפינוי של מד״א בעיר לשבע ניידות, מתוכן שלוש ניידות טיפול נמרץ.
על פי נתונים רשמיים המעודכנים לסיכום השבת, ב-24 השעות האחרונות נקלטו בבתי החולים 102 נפגעים, מתוכם: 2 בינוני והשאר נפגעים במצב קל וחרדה. מהאירוע באילת נקלטו בבתי החולים ילד במצב בינוני, ארבעה נפגעים במצב קל ומספר נפגעי חרדה. במחוז צפון נקלטו בבתי החולים 30 נפגעים במצב קל ובמחוז חיפה 5 נפגעים נוספים. מהאירוע בזרזיר (לפנות בוקר שישי), עדיין מאושפזים בבתי החולים שני נפגעים במצב בינוני ופצוע אחד במצב קל. במשרד הבריאות מסכמים כי הצוותים הרפואיים עובדים במסירות אין קץ לטובת מתן המענה הרפואי, לילות כימים, החל מתחילת המערכה.
