מתקפה ישירה ונוקבת של שר בממשלה נגד צמרת מערכת הביטחון מעוררת הדים נרחבים במערכת הפוליטית והצבאית, עם חשיפת טענות קשות על האופן שבו דרגי המודיעין והפיקוד חרגו לחלוטין מסמכותם המקצועית וקבעו את סדר היום המדיני של מדינת ישראל בשנים שקדמו למתקפת שבעה באוקטובר.
הדברים הקשים נאמרו בכנס הימין של מכון 6:29, שהתקיים במרכז מורשת בגין בירושלים תחת הכותרת "הדיפ סטייט: כיצד יוכל העם לנצח?", שם שרטט שר התפוצות עמיחי שיקלי תמונת מצב מטרידה של כשל מערכתי עמוק ביחסי הדרג המדיני והצבאי.
בדבריו החריפים טען שיקלי כי עד לאסון שמחת תורה התהפכו היוצרות בחדרי קבלת ההחלטות: "עד ה-7.10 ראינו מצב שבו למעשה הדרג הצבאי הוא זה שמוביל את האג'נדה דה פקטו. הדרג המדיני עושה כן עם הראש עם מעט מאוד יכולת אל מול ההערכות המקצועיות. זה השתנה אחרי ה-7.10. ראינו את זה כשהדרג המדיני רצה בתחילת המלחמה לנתק את צפון הרצועה והדרג הצבאי לא רצה לאפשר את זה". שיקלי העמיק בביקורתו על התפיסה שהשתרשה בגופי הביטחון והוסיף: "כשאתה מסתכל על גופי מודיעין כמו אמ"ן ושב"כ, אתה מצפה מהם שמה שיעניין אותם זה לנתח מה הכוונות של האויב ומה היכולות מבחינה צבאית. עמית סער, ראש חטיבת אמ"ן לשעבר, כתב באחד המאמרים המכוננים על איך פורצת מלחמה שאיש לא תכנן אותה. הוא כתב את זה על מלחמת לבנון השנייה, על מבצע צוק איתן. איך חיזבאללה לא רצה מלחמה, איך חמאס לא רצה מלחמה. איך המהלכים היזומים שלנו דרדרו אותנו למלחמה מיותרת. המערכת הצבאית נכנסת למוד מדיני ולא צבאי. איך אנחנו כמערכת מונעים מלחמה, איך מונעים מיסקלקולציה. יש כאן בלבול מוחלט בין מדינאות לבין עיסוק במקצוע הצבאי".
בהמשך נאומו הציג השר את מה שהגדיר כשיא העיוות התפקודי, תוך הפניית אצבע מאשימה מפורשת לגורמי התיאום מול עזה: "המקרה הקיצוני ביותר זה מתפ"ש שהיה שחקן מפתח בעיצוב האג'נדה של הדרג המדיני. הוא היה הגוף שעמד בלב ההטעיה של חמאס. אני לא מאשים אותו בשיתוף פעולה אך הם הלכו שולל. הם הניחו על שולחן הקבינט את התוכנית להודנה ארוכת טווח. למה שמתפ"ש יהיה שחקן שמתעסק בהודנות?".
שיקלי סיכם את דבריו באזהרה ברורה מפני המשך הטשטוש בין תפקידי המטה למקצוע הצבאי: "שב"כ, אמ"ן, אוגדת עזה. כולם היו עסוקים בלהיות מדינאים. חשוב לוודא שדרג צבאי ינתק את עצמו מעיסוק במדינאות. שהדרג הצבאי יסביר על כוונות האויב ולא על המצב הכלכלי. זה מייצר הזנחה של המקצוע הצבאי. גם המל"ל אמור להיות גוף שמאתגר את המערכות הצבאיות ולא היה לנו מל"ל חזק ערב השבעה באוקטובר".