ראש המוסד רומן גופמן החליט שלא לעסוק בפרשת קטארגייט, בשל חשש לניגוד עניינים הנובע מהיכרותו האישית עם גורמים המעורבים בפרשה, ובהם ראש הממשלה בנימין נתניהו ויונתן אוריך.
הפרסום נחשף הערב (חמישי) בחדשות 12, ולפיו בפרקליטות ממתינים לחוות דעת ביטחונית מטעם המוסד, שאמורה לקבוע האם קיימת בפרשה פגיעה בביטחון המדינה. על פי הדיווח, הכנת חוות הדעת התעכבה בין היתר על רקע כניסתו של גופמן לתפקיד ראש המוסד. בעקבות החלטתו להימנע מעיסוק בפרשה, הוקצה במוסד איש מקצוע שיטפל בנושא ויהיה זה שיחתום על חוות הדעת הביטחונית.
ההחלטה משתלבת בהסדר ניגוד העניינים של גופמן, שאינו מחויב בפרסום מלא לציבור. מטרת ההפרדה היא להבטיח כי הטיפול המקצועי בפרשה וחוות הדעת שתועבר לגורמי האכיפה יתקבלו ללא מעורבות של ראש המוסד, בשל קשריו האישיים עם חלק מהמעורבים.
גופמן נכנס לתפקיד ראש המוסד בחודש יוני האחרון, לאחר שבג"ץ דחה את העתירות נגד מינויו וסלל את הדרך לכניסתו לתפקיד. הפרסום הנוכחי מציב סימן שאלה נוסף סביב המשך הטיפול בפרשת קטארגייט, כאשר בפרקליטות ממתינים כעת לחוות הדעת של הגורם המקצועי שיועד לכך במוסד, בטרם תתקבל החלטה לגבי המשך ההליכים בפרשה.