ביהמ"ש השלום בנצרת האריך את מעצרם של שני האסירים הביטחוניים שנתפסו הלילה עד ל-29.9. המשטרה פרסמה תיעוד מתפיסת המחבלים בג'נין.
במשך כמה ימים עקבו במערכת הביטחון, שב"כ ואמ"ן, אחר תנועת המחבלים והבחינו כי שני המחבלים נמצאים בג'נין, ועוברים בין דירות מסתור – בעזרת שני סייענים שנמצאים איתם. באוגדת איו"ש הכינו מבצע כניסה לתוך השטח של העיר ג'נין כדי לעצור אותם, והמבצע המורכב הכיל כמה פרמטרים. המבצע המורכב אושר ביום חמישי האחרון ע"י שר הביטחון בני גנץ והרמטכ"ל אביב כוכבי – ויצא לדרך הלילה.
המבצע המורכב כלל גם כוחות מעצר רבים וגם הרבה כוחות מעטפת. למעטפת חשיבות מיוחדת, משום שהכוחות שביצעו את המעצר נחשפו בלב השטח הבנוי של ג'נין, מאחר והמעצר כלל ירי של הכוחות.
