מאז ספטמבר ועד אמצע אוקטובר 2021 אובחנו בישראל לפחות 11 מקרים של שפעת בעיקר בקרב פעוטות וילדים עד גיל 12 ונכון ל-16 באוקטובר, לפי דו"ח הניטור הדו-שבועי האחרון שפרסם משרד הבריאות, 11 מאושפזים בבתי חולים. זן הנגיף שאובחן הוא מסוג A.
לפי הדו"ח, "נמשכת העלייה בשיעורי התחלואה הנשימתית" וכמו כן נמשכת העלייה בשיעור הפניות למרפאות קהילה בשל זיהום בדרכי הנשימה העליונות. בשבוע האחרון נצפתה עלייה בשיעורי הפניות למרפאות בשל דלקת ריאות. אולם, שיעור תחלואה דמוית שפעת נמוך ודומה לזה שמתקיים בדרך כלל בישראל בין העונות.
אין שינוי משמעותי באחוז הביקורים במיון ילדים ובמיון פנימי בבתי החולים של ה"כללית" בשל דלקת ריאות. אחוז הביקורים במיון ילדים בקרב תינוקות בני שנתיים ומטה בשל ברונכיוליטיס מוסיף להיות גבוה.
בתוך כך דיווח הבוקר (ג') אדיר ינקו ב-Ynet כי קצב התחסנות הילדים כנגד שפעת הוא עתה איטי בהשוואה לשנים קודמות ולפי דיווחי הקופות, את החיסון קיבלו "אחוזים בודדים" מקרב בני חצי שנה עד 12 וההשערה היא שההורים חוששים לחסן את הילדים בו זמנית כנגד קורונה ושפעת למרות שרופאי הילדים והאחיות במרפאות הקהילה מסבירים להם שאין מקום לחשש ואף ניתן לקבל את שני סוגי תרכיבי החיסון במקביל.
המבצע העונתי של חיסוני השפעת בישראל החל לפני כשישה שבועות. רוב המתחסנים עד כה הם, כרגיל, בני 65 ומעלה שהתרגלו לקבל את החיסון באופן קבוע מדי שנה לקראת החורף. לפי נתוני "הכללית" כ-6% מהילדים עד גיל 12 שהם מבוטחי הקופה התחסנו עד כה, ב"מכבי" 4%, במאוחדת 3.2% וב"לאומית" שיעור נמוך אף יותר.
עדיין לא ברור אם תחלואת השפעת בישראל בחורף הנוכחי תדמה לזו שהיתה בחורף הקודם, כלומר נמוכה עד אפסית. עם זאת, בקופות צופים שכאשר החורף יתחיל להתבטא יותר (גשם, קור), ההיענות לקבלת החיסונים תעלה.