באישור היועצת המשפטית לממשלה, המדינה מסרבת לממן בריתות מילה רפורמיות וקונסרבטיביות משום שאינן נערכות כחלק ממערך הגיור הממלכתי של ישראל, כפי שנקבע על ידי הרבנות הראשית, כי יבצע גיורים אורתודוקסיים בלבד, כך דיווח בנדל בישראל היום.
בעקבות זאת עתרו לבג"ץ התנועות הקונסרבטיבית והרפורמית בדרישה כי יורה לפעול באופן שוויוני לשיטתן ויממן גם בריתות מילה שאינן אורתודוקסיות. בעמדת המדינה שהוגשה לבג"ץ, לאחר שאושרה על ידי הייעוץ המשפטי לממשלה, נכתב כי אף שבג"ץ הורה למדינה להכיר בגיורים שאינם אורתודוקסיים הרי ש"המדינה אינה מחויבת לממן ברית מילה במסגרת גיור המבוצע בישראל על ידי גוף פרטי, בין שהוא משתייך לזרם אורתודוקסי, לזרם הרפורמי, או לזרם הקונסרבטיבי. המדינה מממנת רק הליך ברית מילה שנערך במסגרת מערך הגיור הממלכתי".
בדיונים שהתקיימו בנושא הציעו השופטים שהמדינה תממן בריתות מילה שאינן אורתודוקסיות במסגרת משרד הבריאות. השופט פוגלמן אמר בדיון לנציגי המדינה: "יצרתם מונופול בסוגיה של דת ומדינה". השופטת ברק־ארז הציעה "לדאוג למסגרת מימון בתוך המסגרת הממלכתית", והשופט גרוסקופף הצטרף ואמר: "תעשו מבחן תמיכות תקציביות שיתמוך בהם".
