על רקע ההתקדמות המשמעותית במגעים המדיניים והערכות בכירים כי הסכם עשוי להיחתם בשעות הקרובות, השלימה מערכת הבריאות את היערכותה לקליטת החוזרים מהשבי, תכנית פעולה מקיפה גובשה בשיתוף כלל הגורמים המעורבים, הכוללת מענה רפואי, נפשי ולוגיסטי.
חמישה מרכזים רפואיים מרכזיים הוכשרו לקליטה מיידית, תוך התאמה למצבים המורכבים הצפויים, במקביל להתפתחויות המדיניות המסתמנות, השלימה מערכת הבריאות את היערכותה המבצעית. בתי החולים בילינסון-שניידר, שיבא, איכילוב, אסף הרופא וסורוקה הוגדרו כמרכזים הקולטים, כאשר החלוקה ביניהם תיעשה בהתאם למצבם הרפואי והנפשי של החוזרים.
משרד הבריאות הנחה את הצוותים הרפואיים להימנע מתקשורת עם גורמי התקשורת עד להודעה חדשה, מתוך התחשבות במשפחות ובמורכבות התקופה. במקביל, הושלמה הכנת פרוטוקול מפורט לקליטה ראשונית, הכולל הנחיות מדויקות לצוותים המטפלים, תהליך הקליטה יתחיל בהערכה רפואית מיידית, כולל אפשרות לפינוי אווירי במקרה הצורך. לאחר הזיהוי הראשוני והמפגש עם אנשי הצוות, יועברו החוזרים למתחם מיוחד שהוכן עבורם, שם יוכלו להתרענן ולקבל ביגוד חדש טרם המפגש המשפחתי הראשון.
הצוותים הרפואיים קיבלו הנחיות מפורטות לגבי אופן התקשורת הראשונית: יצירת קשר ראשוני תיעשה בגובה העיניים, תוך שמירה על מרחק מכבד, מתן הסבר מתמיד על המיקום והתהליכים הצפויים והתייחסות לצרכים בסיסיים כגון מזון, שתייה ומנוחה. כמו כן, ביצוע הערכה נפשית ראשונית תוך רגישות מרבית ומתן מרחב לביטוי רגשי טבעי ללא לחץ או הכוונה.
לכל חוזר תוצמד עובדת סוציאלית שתלווה את תהליך השיקום ארוך הטווח. הצוותים הונחו במפורש שלא למסור מידע על אירועים טראומטיים או אובדן, גם אם יישאלו ישירות, מערך שיתוף הפעולה כולל את כל הגורמים הרלוונטיים: צה"ל, שב"כ, משטרת ישראל, משרד הבריאות, הצלב האדום והרשויות המצריות. התיאום המדויק ייקבע בהתאם למתווה הסופי שיאושר על ידי הדרג המדיני.
בכיר במערכת הבריאות אישר כי המערכת נמצאת בכוננות גבוהה: "אנחנו ערוכים לקליטה מיידית". על פי ההערכות, אם ההסכם יאושר מחר, שחרור ראשון של חטופים עשוי להתבצע כבר ביום ראשון.
