חבר מועצת הרבנות הראשית ונשיא איגוד רבני הקהילות, הגאון הרב שמואל אליהו, התבטא בחריפות נגד מינויו של יצחק עמית לנשיא בית המשפט העליון.
לדברי הגאון הרב אליהו, "אנחנו ומאות רבנים שאיתנו לא מכירים ביצחק עמית כשופט וכנשיא בית המשפט העליון. לפני שהוא נושא את עיניו לתפקיד כל כך חשוב, הוא חייב לנקות את עצמו מכל החשדות החמורים שדבקו בו".
הרב גם תקף את תהליך המינוי וטען כי "המחטף שלו ושל חבריו מאבד את שארית האמון שהייתה לציבור במערכת המשפט".
ואם היה נבחר מישהו אחר? או בתהליך כשיר וסדור אחר, כן היה לנו אמון?
הציונות הדתית ורבניה שכחו שמדובר בערכאות שמתנהלות שלא ע'פ חוקי התורה.