צמרת הנהגת חמאס בקטאר נעלמה מעל פני השטח, לאחר התקיפה הישראלית בקטאר. הבכירים, בהם ח'ליל אל-חיה, זאהר ג'בארין, מוסא אבו מרזוק, ניזאר עוודאללה, מוחמד איסמאעיל דרוויש וחוסאם בדראן, אינם נראים בציבור ושומרים על פרופיל נמוך במיוחד. המהלך נועד, ככל הנראה, למנוע תקיפות נוספות.
גורמים המקורבים לארגון מסרו לחדשות 12 כי כוחות הביטחון הקטארים העבירו הנחיות נוקשות לבכירי חמאס. ההוראות כוללות איסור על שימוש בטלפונים, הימנעות מיציאה מהבתים וניהול שגרת חיים תחת מעטה של חשאיות מוחלטת. ככל הנראה, ההנחיות נובעות מחשש מוצק מפני ניסיונות סיכול נוספים מצד ישראל. האמצעים המוגברים מורגשים היטב, ואף בלטו במהלך תפילת ההלוויה שנערכה בקטאר. גורמים בארגון הטרור ציינו כי: "התפילה בקטאר התקיימה תחת סידורי ביטחון מיוחדים".
אחד הבכירים המרכזיים שנעדרים הוא ח'ליל אל-חיה, שעל פי פרסומים של חמאס, אף השתתף בתפילת האשכבה לבנו המאם, שחוסל ככל הנראה במהלך התקיפה. למרות ההודעה הרשמית על הישרדותו והשתתפותו, עד כה לא פורסם כל תיעוד המאשר זאת. העובדה שאל-חיה לא נראה בפומבי מעלה סימני שאלה בנוגע למצבו. הבכיר היחיד שנראה בציבור מאז האירוע הוא טאהר א-נונו, שהתראיין אמש לרשת "אל-ג'זירה". נוכחותו בפומבי, לעומת היעלמותם של שאר הבכירים, מעידה על רמת המתח והחשש השוררים בארגון הטרור.