הפיגוע הקשה בגזרת בית שאן ועפולה מעורר סערה פוליטית וביטחונית רחבה, כאשר ראשי ההתיישבות מצביעים על קשר ישיר בין היעדר הנוכחות הצבאית והאזרחית בצפון השומרון לבין חדירת המחבל.
יוסי דגן, ראש מועצת שומרון, אמר בתגובה לפיגוע הרצחני: ״הפיגוע הנורא הזה הוא תוצאה ישירה של הגירוש מצפון השומרון. המחבל שיצא מקבאטיה הגיע מתוך חממת טרור שהתפתחה באין מפריע כי אין שם נוכחות של התיישבות יהודית וצבא בצורה קבועה. הוכח פעם אחר פעם – איפה שאין התיישבות, יש טרור שמאיים על כל רחבי הארץ״. דגן קרא לפעולה צבאית נרחבת והוסיף: ״יש לפעול בנחישות נגד כפר המרצחים קבאטיה, לצאת לתמרון מיידי ונרחב בקבאטיה כפי שנעשה בג׳נין, ולהקים מיידית את כל היישובים שנעקרו בצפון השומרון, כי במקום שיש התיישבות – יש ביטחון״.
אל דרישות אלו הצטרף ראש מועצת בנימין ויו"ר מועצת יש"ע ישראל גנץ, שתקף את ההסתמכות על מכשולי ההפרדה ומסר בתגובה לפיגוע: "הפיגוע הרצחני שבוצע על ידי מחבל מצפון השומרון מוכיח שוב – אין ואקום ביטחוני. אי אפשר להסתתר מאחורי גדרות וחומות ולקוות שהמציאות תשתנה מעצמה. זה היה הכשל של שבעה באוקטובר – וזה הכשל שחוזר על עצמו גם היום.
הרכב שבו ביצע המחבל את הפיגוע. צילום: משה רחמין
הקונספציה של גדר ההפרדה התנפצה היום בפעם המי יודע כמה. הגדרות לא מגנות עלינו אלא הינן חלק מהבעיה. כל עוד נמשיך להתייחס ליהודה ושומרון כאזור שאינו רשמית חלק ממדינת ישראל – המחבלים ימשיכו לנסות להכות בנו בעפולה, בבית שאן, בראשון לציון ובתל אביב. הדרך היחידה לנצח את הטרור היא בהחלת ריבונות ישראלית מלאה ובהצבת עובדה ברורה: זו ארצנו, ואנחנו אחראים לביטחון בה. הגיע הזמן להתעשת ולהפסיק לנסות לאטום פריצה – עם פלסטר".
גם בדרג הביצועי של מועצת יש"ע הביעו חשש כבד מהקלות שבה חודר הטרור לעורף הישראלי, עומר רחמים מנכ״ל מועצת יש״ע אמר בתגובה לפיגוע הרצחני: "הקלות והמהירות בה מחבל מתועב הגיע לבית שאן ונעצר רק בעפולה היא עוד הוכחה לאיך עלול להראות בעפולה, כפר סבא ות״א שחזור של טבח השביעי באוקטובר. כפי שאמרנו כל העת – חובה לגדוע את התקווה שהפיחו באירופה להקמת מדינת טרור. התגובה לפיגוע – ריבונות!".
בתוך כך, מפקד חטיבת הבקעה והעמקים, אלוף-משנה ג' ומפקדים נוספים קפצו מוקדם יותר היום לזירת הפיגוע בבית שאן לביצוע הערכות מצב ונקיטת צעדים ופעולות להמשך. כמו כן, הרמטכ״ל אייל זמיר מקיים כעת הערכת מצב בהשתתפות מפקדים וגופי ביטחון נוספים כדי לגבש את המענה המבצעי המיידי. במקביל, המפכ"ל דני לוי נמצא כעת בזירת הפיגוע בצומת המעונות בעפולה.