בזמן שארגון הטרור חמאס ממשיך להתחזק בלבנון ומהדק את שיתוף הפעולה עם חיזבאללה, הג'יהאד האסלאמי מבסס בחשאי כוח צבאי משמעותי על אדמת סוריה – כך פורסם הבוקר (רביעי) לראשונה ברשת ב'.
ארגון הג'יהאד האסלאמי מחזק בשבועות האחרונים ביתר שאת את מוקדי הכוח של הזרוע הצבאית שלו בסוריה, ובעיקר במחנות הפליטים הפלסטינים באזור דמשק.
על פי ההערכות בארגון הטרור, סוריה מהווה כעת אזור נוח להתבססות צבאית מול ישראל. זאת, בשל האיסור הלא-רשמי של ארצות הברית על ישראל לתקוף על אדמת סוריה.
למשטרו של אחמד א-שרע יש שליח מיוחד שתפקידו לייצר תקשורת מול הנהגת הג'יהאד האסלאמי.