בתום ארבעים ושמונה ימי לחימה עצימים באיראן, שכללו גלי הפצצות חסרי תקדים, התמונה המודיעינית המתגבשת מעוררת דאגה עמוקה בקרב מקבלי ההחלטות בישראל וארה"ב. על פי הערכות של גורמים רשמיים ומומחים, איראן יצאה מהמערכה הצבאית כשהיא שומרת על רוב המרכיבים הדרושים לפיתוח נשק גרעיני, נתון שמעניק למשטר בטהראן עמדת פתיחה חזקה וקלף מיקוח משמעותי בסבבי המשא ומתן העתידיים מול הממשל בוושינגטון.
למרות הפגיעה הפיזית במעבדות מחקר ובמתקנים ששימשו את התוכנית, ובפרט הנזק שנגרם לתוכנית העשרת האורניום עם השמדת האתר לייצור "עוגה צהובה", המערכת המרכזית נותרה פעילה בחלקה הגדול. כפי שדווח היום (ראשון) בוול סטריט ג'ורנל, ההערכה המרכזית היא כי איראן עדיין מחזיקה בצנטריפוגות ובאתר תת-קרקעי שבו היא עלולה להמשיך להעשיר אורניום. מדובר בהישג שרידותי מרשים עבור האיראנים, שהצליחו להסתיר נכסים אסטרטגיים במעמקי האדמה.
הנתונים המדאיגים ביותר נוגעים למלאי החומר הבקיע שנותר בידי טהראן. לפי הדיווח, איראן הצליחה לשמור על מאגר של כ-440 ק"ג אורניום מועשר ברמה של 60%, הקרובה לזו הנדרשת לנשק גרעיני. מידע שהגיע מהסוכנות הבין-לאומית לאנרגיה אטומית מצביע על כך שכמחצית מהחומר הזה הוסתרה בתוך מכלים במנהרה עמוקה מתחת לאתר הגרעין באספהאן, הרחק מהישג ידם של המטוסים.
הבדלי הגישות בין ישראל לארצות הברית במהלך המלחמה השפיעו ישירות על התוצאה הנוכחית. בעוד שעיקר הפגיעה בתשתיות הגרעין התרחש עוד במערכות קודמות, במהלך חמשת השבועות האחרונים התמקדו האמריקנים בעיקר בפגיעה במערכי טילים ונשק קונבנציונלי. לעומת זאת, ישראל היא זו שהמשיכה לתקוף יעדים הקשורים ישירות לתוכנית הגרעין, וגורמים ישראליים אמרו כי הותקפו מגוון אתרים שבהם התנהלה פעילות הקשורה לפיתוח נשק גרעיני.
בשורת הסיכום, האתגר הדיפלומטי והצבאי נותר בעינו. מומחים מעריכים כי איראן עדיין מחזיקה ברוב היכולות הדרושות לייצור פצצה, כולל הצנטריפוגות ומאגר האורניום. החשש הגדול מתמקד כעת באתרים תת-קרקעיים שלא נבדקו, כמו המתקן באספהאן שעליו הוצהר רק לאחרונה, ומתחם המנהרות המבוצר סמוך לנתנז, המוכר גם בשם "הר הפיקאקס". במקומות אלו, כך חוששים במערב, ניתן להמשיך בפעילות גרעינית מחוץ להישג ידם של אמצעי התקיפה החזקים ביותר והפצצות חודרות הבונקרים האימתניות ביותר.